Clínica Gynetrisur está ubicada en la zona centro de Córdoba, exactamente en la conocida Avda. de las Ollerías nº48 (antes Obispo Pérez Muñoz), junto al Instituto de la Mujer.

Se accede fácilmente desde toda la provincia; la entrada más próxima es por la autovía dirección Córdoba Norte.

Desde la estación, tanto ferroviaria como de autobuses, se llega a la clínica a pie en 15 minutos aproximadamente. Tiene buen acceso al transporte urbano, así las líneas 2, 4 y 6 tienen paradas a menos de 50 metros de la Clínica.